菌落計數,是微生物實驗中基本又耗時的一項操作。近年來,出現一些菌落計數儀,為常規菌落檢測提供了方便。但對一些復雜情況,例如菌落表面皺褶嚴重、邊緣輪廓模糊、菌落顏色與培養基顏色非常接近、菌落生長在含有網格的濾膜上等等,一般菌落計數儀就無法實現計數統計。
針對此類型的復雜平皿,迅數大膽創新研發出基于水平集活動輪廓模型的圖像分割方法。它是將水平集方法和活動輪廓模型結合起來,在極小化能量泛函的過程中活動輪廓不斷逼近分割目標,直到活動輪廓線停止進化時分割完成。由于該方法具有抗噪性強、數值求解穩定性好、分割邊界光滑連續、可以處理拓撲結構復雜的情況等優點,成為目前上zui前沿的圖像分割技術之一。
菌落計數儀因為其自動化程度高,大大節省人力、時間,而被各大科研院所、食品藥品企業、質檢所等檢測機構所用。在使用的過程中因為微生物的不同性,而造成有些平皿不能夠很好的做出的統計,這給用戶和廠家都帶來了巨大的難題。為解決上述復雜情況下的菌落統計,迅數科技團隊歷經兩年攻關,結合具體問題進行大膽嘗試、改進和創新,終于成功開發出一系列針對不同菌落特點的分割統計方法。
該方法的基本原理,是把曲線或曲面嵌入高一維水平集函數中,用一個高維函數來表達低維曲線或曲面的演化過程。
采用多相水平集快速活動輪廓模型算法,針對上述復雜平皿來,尤其是多霉菌平皿,由于其表面毛糙而導致灰度分布不均勻、邊緣毛糙不連續,導致分割效果很差,采用迅數多相水平集活動輪廓模型快速算法的分割效果,除了部分霉菌粘連非常嚴重導致沒有區分之外,能夠對絕大多數的霉菌進行良好的分割。
濾膜與3M測試片的創新統計:
濾膜與3M測試片,越來越多的應用于生物、醫藥、食品、環境等領域的微生物檢測。很多濾膜或測試片都有一個特點,就是在其表面有著不同顏色不同大小的網格線。這些網格有助于人工觀測計數,但卻給目前使用越來越多的菌落計數儀帶來困難。因為網格的顏色往往很深,導致傳統的方法往往檢測到網格而不是菌落。下圖4、5、6分別顯示了三種常用的濾膜和3M測試片,以及采用傳統圖像分割方法的分割結果。
展示了采用青島眾瑞智能儀器有限公司開發的“基于形態約束的水平集活動輪廓模型”,對網格濾膜和 3M測試片的檢測效果。其中,a、b、c分別是塞多利斯濾膜、3M金黃色葡萄球菌測試片、3M大腸桿菌測試片的原圖。d、e、f是采用“基于形態約束的水平集活動輪廓模型”后的分割效果。由于具有圓形約束,活動輪廓避免了對網格的逼近,而zui終檢測出全部圓形菌落。